Неправительственное сотрудничество осуществляется с Организацией Объединенных Наций (ООН), Международной Ассоциацией Геронтологии и Гериатрии (МАГГ). Институт включен в список научно-исследовательских центров, сотрудничающих в рамках «Программы ООН по дальнейшим исследованиям старения в XXI век». Научно-исследовательская и лечебно-практическая работа Института осуществляется в тесном взаимодействии с научными учреждениями России и Европы.

В апреле 2009 г. по решению Совета Международной ассоциации геронтологии и гериатрии в Санкт-Петербурге на базе Санкт-Петербургского института биорегуляции и геронтологии СЗО РАМН был создан Сотрудничающий центр МАГГ (IAGG Collaborating Centre). 6 июля 2009 г. на заседании Совета Международной ассоциации геронтологии и гериатрии в Париже (Франция) в рамках XIX  Всемирного конгресса по геронтологии и гериатрии состоялось торжественное вручение сертификата: Сотрудничающего центра МАГГ директору Санкт-Петербургского института биорегуляции и геронтологии СЗО РАМН члену-корреспонденту РАМН профессору В.Х. Хавинсону. В свою очередь профессор В.Х. Хавинсон представил план деятельности Сотрудничающего центра МАГГ на период его работы с апреля 2009 г. по март  2013 г.